他为了能够死亡，选择了侦探之路……时值2030年代。聚集于谜之侦探·明智小五郎身边的「少年侦探团」，他们凭借着自己的行动力，解决了许多大大小小的事件。某一日，成员之一的花崎健介与谜之少年·小林芳雄相遇了。由于「不明雾霭」而成为了"死不了"体质的小林，渴望着自身的死亡，拒绝着与他人的接触。对着这样的小林抱有了兴趣的花崎，向小林提案「加入『少年侦探团』吗」。小林与花崎，他们的相遇终是与世纪罪犯·怪人二十面相和明智小五郎之间的因缘相缠结，他们两人的命运就此转动…