故事设定在一个身怀魔力的人类濒临灭绝的世界,武力的最高境界从使用利剑,转而到使用魔法,继而变成了使用枪械.就读于以取缔残存魔力威胁的"异端审问官"专业机关——"对魔导学园"的男主角草薙哮,是个完全不会使用枪械,只靠一柄刀与敌人交锋的另类.而他率领的第35试验小队又被称为"杂鱼小队",顾名思义是由一群劣等生拼凑而成的团队.某一天,拥有"魔女猎人"资格的超精英持枪高手凤樱花,竟然加入了这支队伍.在带领队员动身执行回收魔导遗产的任务中,一场学园动作奇幻大作就此开始.