蔷薇少女樱田纯,一名不愿上学而长期不出家门的中学生,热衷于上网购物,喜欢在购买物品后的退货限期内退回物品。有一天,樱田纯收到一封自称是人工精灵崛江的来信,上面只写一个上发条还是不上发条的选项,在好奇心驱使下纯选择了上发条,之后房间就出现了一个没有署名的神秘皮箱,里面装着一个非常美丽而且质感近似真人的少女人偶,使用木箱内的发条转动背部的开关后,人偶像有生命般的活动起来,并且告诉纯她的名字是真红。在万般无奈下不明白怎么回事就糊里糊涂地成为了真红的媒介,结下了主仆关系。之后,一个结下类似契约的人类和人偶出现在纯和真红面前。称为Rozen Maiden(蔷薇少女) 的人偶们的战斗就此展开了。