《企鹅娘》故事发生在私立北极学园,芳龄14岁,外号“企鹅”的御宅族少女(原作称“少女A”,A=AKIBA=秋叶原)转学至此,她同时也是超有钱的南极集团千金,后来成为学生会长.满脑子的价值观以动画为中心,作为兴趣的COSPLAY更是家常便饭,特技是在COSPLAY状态下便可发挥该角色的能力.登场人物多以南北极动物为名(如企鹅,鲸鱼),围绕着御宅族少女与学校里的朋友,发生着各种各样的爆笑故事.