在行星Zi上,一心希望成为象父亲那样成为优秀的zoids机师的少年邦,同欧卡诺伊多(Organoid)奇克和神秘少女菲妮一起踏上找寻zoids eve的旅途,并粉碎了帝国首相普罗因兹企图控制帝国,占领共和国的野心.四年后,邦,菲妮都已经长大.为了对抗日益猖獗的使用zoids的恐怖活动,共和国和帝国合作组织了一支由两国精英构成的特殊部队——守护者力量(Guardian Force).