主角一名叫伊达健太,与耕一郎他们五人都就读于诸星学园高中,他却与人挑战实验电玩'百万连者', 结果赢了对方,他却无意间被知名世界科学联盟INET的相关人员发掘而进入科学研究所,然而在同一时间,诸星学园的耕一郎四人,他们创办了诸星高中的数码研究社,当然健太也是其中一员,他们未经博士许可,就擅自进入正在开发的航天飞机研究室,结果博士也无可奈何地请他们也成为百万连者,因为来自次元扭曲空间的邪电王国Nejirejia,却开始侵略现实世界的地球,来自邪电博士希磊拉的扭曲支配者邪电王的开战宣言,是必要让现实的世界摧毁也变成极度扭曲的空间,所以健太他们才担此重任,接受MEGA的力量成为保卫地球的战士.