故事发生在历史动荡的幕末年代，拥有“霸者之首”的人便可以获得天下，而这个被视为“至宝”的“霸者之首”顺理成章地成为人们追逐的目标。作为“永远的刺客”，持有灵刀·月泪刀的秋月耀次郎的宿命就是要封印“霸者之首”。以平息人世间的战乱，故事便在秋月耀次郎的游历过程中展开