时间是假想的19世纪末。有人用魔导式将脆弱的灵魂集结制作出不断重复着杀戮的杀人武器AKUMA（恶魔）。制造AKUMA的，是企图将世界引向终结的千年伯爵率领的“诺亚一族”。而能将AKUMA破坏的唯一力量，来自于叫做“黑色教团”的组织的成员们。很久以前就开始的双方持续的战斗、隐藏在背后的真相是？