辉夜姬是日本古老的民间传说，传闻有月之仙女偶落凡间，一男子为想娶她为妻而偷去她的天女羽衣，仙女返不了月，只能留在人间，与这名男子生儿育女。故事沿承这项传说，一开始便写一班被隔离在孤岛的小孩，过着被严格监视的生活，却总是每过一段时日便有小孩无故失！真由、碧与晶是岛上一起长大的好朋友，逃出岛后却流落到不同地方；但相同的是，他们渐渐发觉原来世界上有人和他们长的一模一样！不只他们，岛上所有其它孩子也是，而且与他们有着相同长相的都是些手握重权的政治巨头或超级明星。这绝不是偶然的巧合，而是由不明力量从背后策划的！真由、碧与晶，渐渐卷入一个不能回头的旋涡之中！